Τον Μάιο του 2008, το ελληνικό μέλος του Οργανισμού GS1, GS1 Ελλάς Α.Ε., αποβλήθηκε από τη Γενική Συνέλευση του GS1 για παράβαση του καταστατικού του GS1.
Μετά την αποβολή της, η GS1 Ελλάς επιχείρησε να ανατρέψει την απόφαση της Γενικής Συνέλευσης ενώπιον δικαστηρίου των Βρυξελλών. Μετά από δεκαοκτάμηνη δικαστική διαδικασία, τον Δεκέμβριο του 2009 το Δικαστήριο απέρριψε όλα τα αιτήματα της GS1 Ελλάς. Ως εκ τούτου απαγορεύεται πλέον στην GS1 Ελλάς να εμφανίζεται ως μέλος του Οργανισμού GS1 στην Ελλάδα, να εκδίδει αριθμούς για barcodes του συστήματος GS1 και να χρησιμοποιεί την επωνυμία και τα εμπορικά σήματα GS1. Καθώς η GS1 Ελλάς δεν είναι πλέον Φορέας – Μέλος του GS1, κατά τη διάρκεια των επόμενων μηνών, το κεντρικό γραφείο του GS1 θα υποστηρίξει τη δημιουργία ενός νέου μη κερδοσκοπικού φορέα GS1 στην Ελλάδα από Έλληνες χρήστες, ο οποίος θα τελεί σε συμμόρφωση με το καταστατικό του GS1. Ενόσω διαρκεί η διαδικασία σύστασης του νέου φορέα GS1, οι εγχώριες εταιρείες που χρειάζονται αριθμούς barcodes και σχετική υποστήριξη μπορούν να επικοινωνούν με το κεντρικό γραφείο του GS1 στην ηλεκτρονική διεύθυνση: [email protected] ή μέσω του website: www.gs1greece.org.